生物菌的种类分为；有效活菌数量；菌种数量；菌捕捉臭气分子的活性，分解臭气分子的能力；温度；湿度；风速;接触面都会存在一定的影响。
对于微生物法处理恶臭气体系统来说，从前述的反应机理可以看出，影响处理过程的因素是很多的。这些因素一方面来自于传质过程的影响因子；另一方面来自于微生物生长环境的影响因子。对于生物过滤法而言，填料的特性对脱臭效果起到了十分关键的作用。填料的比表面积、空隙率除了与单位体积填充层生物量有关，还直接影响到整个滤床的压降及是否易堵塞。用经过加工的梧桐树枝和含微生物及N、P等营养物质的添加剂配制的填料作为生物滤箱的填充层，该填判具有较大的吸附表面积和较低的气流压降，便于气体渗透和均匀分御，且造价低，经济实用。
